Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn8Q91VA3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms