Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Odf4Q8VI88 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Odf4Q8VI88 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Odf4Q8VI88 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Odf4Q8VI88 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Odf4Q8VI88 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf4Q8VI88 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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