Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc92Q8VDN4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc92Q8VDN4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1181.9 ms