Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms