Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rpusd1Q8VCZ8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpusd1Q8VCZ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpusd1Q8VCZ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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