Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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