Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med17Q8VCD5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms