Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApobrQ8VBT6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms