Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf183Q8QZS5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf183Q8QZS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf183Q8QZS5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf183Q8QZS5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf183Q8QZS5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf183Q8QZS5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf183Q8QZS5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf183Q8QZS5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf183Q8QZS5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf183Q8QZS5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf183Q8QZS5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf183Q8QZS5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rnf183Q8QZS5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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