Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hoxc12Q8K5B8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hoxc12Q8K5B8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hoxc12Q8K5B8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hoxc12Q8K5B8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hoxc12Q8K5B8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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