Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms