Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolbQ8K409 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms