Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casc3Q8K3W3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc3Q8K3W3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms