Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh16f2Q8K3M1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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