Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OptnQ8K3K8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms