Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms