Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paf1Q8K2T8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paf1Q8K2T8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms