Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms