Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1eQ8K202 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms