Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh3Q8K1E6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms