Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c1Q8K193 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms