Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms