Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1Q8CGF7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms