Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hpf1Q8CFE2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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