Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras1Q8CEC5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms