Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms