Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms