Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms