Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc169Q8BXX9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms