Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn17Q8BXA6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cldn17Q8BXA6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms