Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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