Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms