Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Larp4Q8BWW4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Larp4Q8BWW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Larp4Q8BWW4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Larp4Q8BWW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Larp4Q8BWW4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Larp4Q8BWW4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms