Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms