Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc9Q8BJN4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc9Q8BJN4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms