Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms