Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm29Q8BGX2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm29Q8BGX2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm29Q8BGX2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm29Q8BGX2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm29Q8BGX2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm29Q8BGX2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms