Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms