Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo1Q8BFY9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo1Q8BFY9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms