Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms