Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms