Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms