Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms