Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms