Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttc28Q80XJ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttc28Q80XJ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ttc28Q80XJ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttc28Q80XJ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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