Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Zbed4Q80WQ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Zbed4Q80WQ9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Zbed4Q80WQ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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