Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms