Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms