Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims3Q80U57 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms