Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms